Holzpellets geben starke Gerüche (Gestank) ab, wenn bei der Herstellung sehr viel Kiefernspäne verwendet wurde. Durch den hohen Kieferanteil sind flüchtige Stoffe, wie z. B. Baumharze (in denen unter anderem der Stoff Lignin enthalten ist) auch sehr hoch. Der Ligningehalt ist für den starken Geruch verantwortlich. Der Geruch verflüchtigt sich je nach Vorratslagerbeschaffenheit und Füllmenge nach ca. zwei bis vier Wochen, oder leider auch länger, wieder.